本校標誌以鳳凰為設計核心，融合英文校名縮寫 TUT 重複旋轉排列， 象徵生生不息、永續發展。三隻鳳凰寓意本校自「台南家專」、 「台南女子技術學院」至「台南應用科技大學」三個重要發展階段， 展現承先啟後、浴火重生的精神；透過鳳凰嘴喙與翅膀交錯穿插的造形， 形成循環翻轉的視覺意象，並呼應校訓「學思相長」， 象徵師生相互學習、攜手成長、展翅高飛。

本校奉教育部核定自99年10月1日起更名為「台南應用科技大學」， 秉持「文創當先・應用為本」的辦學理念， 持續邁向優質文創學府。